Ответ на вопрос "можно ли уход герасима считать протестом? "

Можно. он протестовал против такого отношения к себе.

Да, :

Восстанию пугачёва, петруша нашёл своё счастье (и маша тоже) , стал настоящим человеком и мужчиной: закалился духовно и (а служа в петербурге, он только опустился бы и развратился) , научился видеть не только плохое в "плохих" людях, но и их достоинства, лучше узнал свой народ, научился лучше разбираться в людях (пример знакомства с зуриным) , выработал свое мировоззрение, научился быть самостоятельным, стал милосерднее, добрее, умнее, мудрее, терпимее к недостаткам других, решительнее..   швабрин тоже показал своё истинное лицо, свою предательскую сущность и подлость в отношении своих друзей и, можно сказать, благодетелей (кап. миронова и его жены) тоже пугачёвскому бунту.  повлияло это событие и на всех второстепенных героев.  и на правительство тоже: показало, что армия не подготовлена к неожиданным военным действиям в случае войны (тряпки и всякий мусор в дуле пушки, в связи с чем пугачёв мгновенно сметал все крепости на своём пути) .  вывод: именно в переломные моменты человек сбрасывает свои маски и становится самим собой. причём в процесс событий, как правило, сильный (или средний, хотя бы) и порядочный становится ещё сильнее и лучше, а слабого и нравственно неустойчивого они ломают.